医疗信息作为公共资源的存在，在卫生厅卫生行政部门备案的同时向社会公开。目前医院信息化建设中，大多数医院为了保证既得利益而隐藏医疗信息，或者在拥有医保卡的同时，还需要办理多家医疗诊疗诊医院疗诊卡在不同医院诊断时，往往进行多次的各种同种检查，损害了患者的利益。不同医院信息不能共享，诊疗卡带来的额外利润，医院难以放弃，信息化建设互通较为困难。
如果有经常去医院的很熟悉，你在A医院拍了X光片，然后由于种种原因，你需要去B医院就诊，那么你还要做在B医院的X光片，之前花的钱白花了。你抱怨，你觉得浪费，但是这是每个医院的规矩，你不遵守可以，那你就去之前的A那里治疗好了。
为什么会这样呢？
当然是利益考虑，你在A院拍了片子，费用几百块，那么你去B医院，也是一样或者是更贵的X光机，同时还配备了X光的医生，如果你又去B医院不做X光片就用A医院的，那这个仪器和人员成本A医院会分给B医院么？不能，ok，你愿意治就重新再拍！大家都知道，检测的费用都不是很低，一个人拍一个片子，一天上百个上千个患者，这个收入非常可观啊，谁会让出自己的利益呢？
如何解决：国家要迅速统一医院信息化的标准，并紧抓落实。缺乏标准的信息化建设会形成一个个“信息孤岛”，将失去生命力。只有统一了标准才能使医院内部网络互联互通、互操作、资源共享，对外才能与医保、社保、医疗保健银、上级行政部门等信息系统可靠联接。因此加速建立“医院信息系统标准体系”势在必行。病人信息共享，及时准确全面地为临床医生提供病人信息。电子病历系统有能力收集分散在各个信息点上的医疗信息，它记录了病人一生的健康信息，包括病人主索引信息、病人访问信息、电子病历。在医院的技术部门中，采用lis系统或pacs系统、手术麻醉系统等都能够为实验或者相关科室提供方便，同时有利于医院管理水平及医疗质量的提高，信息化系统应用越来越广泛，电子病例、患者信息不断完善。
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从技术因素来看，信息技术及产品的更新太快，用户跟不上，无所适从。从非技术因素来看，医院领导的管理观念、医院的组织结构、工作模式要适应管理信息化的要求。医院信息系统的标准、规范仍有待进一步加强与完善。系统互联、资源共享的问题解决得不是很好，原因就是技术和标准尚不够规范。
很多很有实用价值的信息化模块，没人会用，都要跟乙方请教，很多医护管理工作者，每天很忙碌，没时间抽出时间不停的解决应用问题，让使用系统成了困难。
如何解决：HIS实施的关键环节和前提有三个方面：首先要优化医院管理，其次要规范医疗流程，最后一定要以本单位为主导，而不是以厂商为主导。以使用人员为主体，首先制定出切实合理的需求分析，以信息化的手段来提升医院的管理水平是医院信息化建设的出发点。
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医院的一把手，一般都是“医”而优则仕，都是医生出身，又精通医学同时又有信息化建设的专长，这种人才很稀缺，本身医院不是孕育信息化人才的而是主要培养优秀医生的。
这样一来，不懂信息化建设的院长指挥不懂医疗的it人员，来执行需要各级各系的医护都要参与执行的策略，其结果可想而知——沟通和认知容易产生问题，医院信息化人才匮乏是医院信息化建设的瓶颈。医院信息化建设中的系统与软件开发、推广平台的建设、后期系统维护等都离不开专业的信息化人才，而目前行业人才缺口较大，医院很难得到同时具备专业医学知识和丰富信息化技术的复合型人才，导致医院的信息化建设停滞不前，一些建设好的信息化设备也难以充分发挥作用。
如何解决：医院管理层对于信息化建设工作要持有大力肯定的态度，转变管理方式，主动与专于信息化建设的人员沟通，共同应对医院信息化建设过程中遇到的众多棘手问题，对信息化建设带来的长远效益看好并坚定执行。
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医院缺乏对信息化系统的安全管理措施，对于保密协议、第三方权限、密码相关因素没有进行完善，导致系统出现漏洞，关键信息与患者资料同时有泄露的可能，缺乏安全软件，没有相关技术人员及及时进行漏洞修复，都使医院信息化安全存在严重问题。
如何解决：医院要定期对系统进行安全性检测，加快信息化产品标准的制定，在同类产品中进行严格筛选，根据安全性、质量、成本多方面综合考虑。设备应用前加强使用人员的培训，设立相关注意事项，规范产品接口、数据模型等问题，增强与开发商沟通，尽可能满足医院要求，购置相关安全软件，定期更换密室，设立防火墙等，充分保证系统安全。
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医院信息化建设过程中需要大量的资金投入，建设周期长，短期内很难取得效益，并且短期内不能对服务质量与医院的管理产生良性影响，导致部分管理人员不重视建设信息化处及管理方式和老的管理方式的变更，管理人员适应性差，有抗拒心理，忽视建设中出现的问题，有时故意的将建设过程中的阻力增大。
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医院信息化建设工作科技含量较高，对技术、资金方面的要求也相对较高，但是目前，我国医院在信息化建设方面的资金十分缺乏。很多医院在没有充足资金的情况下选择了忽视信息化建设工作，一些资金较为充足的医院在信息化建设前期会投入大量的资金，但是中后期也往往会因为未能获得与投入相符的经济效益而逐渐减少资金投入，延缓了医院信息化建设的步伐。
如何解决：运维类资金来源分为本院自筹、财政投入、合作与借贷和其他来源。调查显示，信息化运维资金以本院自筹方式为主，三级、二级及其他医院占比分别为98.4%、95.9%和81.2%。计划周全，量入为出。
